Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpd52Q62393 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms