Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf6Q62311 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms