Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn1Q62261 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn1Q62261 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms