Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Npm1Q61937 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Npm1Q61937 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms