Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AtrxQ61687 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AtrxQ61687 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AtrxQ61687 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AtrxQ61687 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms