Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2aQ61194 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms