Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf9Q61179 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms