Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf8Q60846 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms