Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms