Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcf4Q60722 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf4Q60722 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms