Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms