Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd4Q60688 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms