Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sik1Q60670 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sik1Q60670 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms