Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CttnQ60598 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CttnQ60598 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms