Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf123Q5XPI3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms