Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc125Q5U465 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms