Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms