Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sun3Q5SS91 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sun3Q5SS91 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms