Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf215Q5SPX3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms