Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtp3Q5QGU6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms