Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6bQ5NCY0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms