Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms