Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm12253Q5NC48 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm12253Q5NC48 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm12253Q5NC48 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm12253Q5NC48 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm12253Q5NC48 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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