Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
1810065E05RikQ5NC41 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1810065E05RikQ5NC41 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1810065E05RikQ5NC41 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms