Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH2

Tsr3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr3Q5HZH2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr3Q5HZH2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms