Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG6

Hspb6, Heat shock protein beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb6Q5EBG6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hspb6Q5EBG6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspb6Q5EBG6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms