Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CenpjQ569L8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpjQ569L8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms