Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig2Q52KR2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms