Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms