Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UZV7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UZV7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UZV7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UZV7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UZV7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UZV7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms