Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms