Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pate2Q3UW31 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate2Q3UW31 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate2Q3UW31 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate2Q3UW31 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate2Q3UW31 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pate2Q3UW31 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms