Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms