Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms