Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrch2Q3UMG5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms