Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cobll1Q3UMF0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms