Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam83fQ3UKU4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam83fQ3UKU4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms