Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Edc4Q3UJB9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms