Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms