Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vars2Q3U2A8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms