Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc28Q3TX51 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc28Q3TX51 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms