Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Smarca4Q3TKT4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Smarca4Q3TKT4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms