Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms