Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpm1Q2TV84 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm1Q2TV84 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms