Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Lingo4Q149C3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Lingo4Q149C3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lingo4Q149C3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Lingo4Q149C3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Lingo4Q149C3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Lingo4Q149C3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Lingo4Q149C3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Lingo4Q149C3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Lingo4Q149C3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Lingo4Q149C3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Lingo4Q149C3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Lingo4Q149C3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo4Q149C3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms