Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms