Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli2Q0VGT2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli2Q0VGT2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms