Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms