Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms