Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou6f1Q07916 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms